Religiøse grupper i Tyskland kan virke under forskjellige juridiske former som er åpne for både religiøse og ikke-religiøse samfunn, og som strekker seg fra ideelle foreninger til enheter under offentlig rett. Scientology-kirker i Tyskland er registrert under den juridiske formen ideelle foreninger, med deres religiøse mål klart og tydelig uttrykt. Og som sådan er deres formelle juridiske status ikke noe annerledes enn mange andre anerkjente religiøse samfunn, så som buddhister, muslimer, hinduer, kvekere, Jehovas vitner og medlemmer av bahai-troen.
Gjennom de siste tretti årene har tyske domstoler – i rundt femti avgjørelser – besluttet at kirken og dens medlemmer er beskyttet av religionsfrihet som garantert av artikkel 4 i Tysklands grunnlov.*
For eksempel:
- I saken Hoppe gegen Scientology Kirche Hamburg e.V. (dom av 5. januar 1998, akt nr. 330 O 169/97), bekreftet Hamburgs høyesterett at kirken er «anerkjent som et religiøst trossamfunn» og er beskyttet ifølge artikkel 4 i grunnloven.
- I saken Krueger gegen Freie und Hansestadt Hamburg angående byen Hamburgs bruk av et «sekt-filter» som krevde at forretningspartnere måtte erklære at de ikke hadde noen befatning med Scientology, avgjorde både Hamburgs ankedomstol (dom av 17. juni 2004 akt nr. 1 Bf 198/00) og den høyeste føderale forvaltningsdomstol vedrørende lovanvendelsesanke (endelig dom av 15. desember 2005, akt nr. 7 C 20.04) at «den saksøkende part, vedrørende sin praksis som scientolog, kan kreve beskyttelse av den religiøse eller filosofiske trosretningen i følge artikkel 4 del 1 av den tyske grunnloven». Basert på denne dommen nedla domstolene forbud mot byen Hamburg om å bruke sektfilteret.
Tyske domstoler har gjentatte ganger stadfestet at artikkel 4 i den tyske grunnloven, angående religions-, samvittighets- og trosfrihet, gjelder for scientologer og Scientology-kirken.
«Hele omfanget av Scientology-organisasjonens ideer har å gjøre med transcendentalt innhold og Menneskets posisjon og betydning i verden. Hvis denne læren av L. Ron Hubbard vedrørende den udødelige sjelen som bæreren av livsenergi (THETA) og vedrørende THETANEN, og angående dens forhold til det materielle universet betegnet som MEST, og angående sjelens vei gjennom utallige livstider, er antatt som tro, og hvis man har samfølelse med veien til høyere eksistensnivåer (CLEAR og [OPERERENDE] THETAN) som minner en om nivåer av frelse, da kjennetegner dette en filosofisk overbevisning eller en religiøs trosretning.»