Cirka 30 religiøse organisasjoner er registrert hos Innenriksdepartementets avdeling for religiøse affærer i Taiwan. Religiøse organisasjoner kan registreres hos de sentrale myndighetene gjennom deres filialer over hele øya ifølge Tempelforvaltningsloven, Loven om samfunnsorganisasjoner eller kapittelet i Sivilloven som regulerer stiftelser og foreninger. Den 14. mars 2003 innførte Innenriksdepartementet i Taiwan Scientology-kirken i registeret over formelt anerkjente religiøse organisasjoner.
«Så snart søkeren anses som en ny religion må den sende inn data om sine egne religiøse doktriner, formål, skrifter, ritualer og religiøse organisasjonsstrukturer osv. til departementet som opplysende bilag. Derfor har deres organisasjon blitt godkjent for oppgradering til et nasjonalt religiøst samfunn. Så det er nå et faktum at deres samfunn er akseptert som en ny religion.»
