Statens krav for juridisk anerkjennelse av religiøse grupper i Nicaragua ligner kravene for andre ikke-statlige organisasjoner. En gruppe må søke om personería jurídica (juridisk person), som nasjonalforsamlingen må godkjenne. Etter godkjennelsen må gruppen registreres av myndighetene som en forening eller stiftelse.
Kirken søkte om anerkjennelse som en religiøs organisasjon, hvilket ble tilkjent. Ifølge dekret 4734 fra presidenten i Republikken Nicaragua, utgitt i den offisielle journalen den 7. september 2006, ble Scientology-kirken i Nicaragua registrert som en religiøs forening.
«Presidenten og nasjonalforsamlingen i Republikken Nicaragua erklærer det følgende: Juridisk kapasitet innvilges til Scientology-kirken i Nicaragua, en nonprofit forening med uendelig varighet, med hjemsted i byen Managua i regionen Managua.»