I Nederland er det ikke noe spørsmål fra myndighetenes side angående Scientology-kirkens religiøse status og beskaffenhet. I årens løp har både de utøvende myndighetene og domstolene utstedt tallrike anerkjennelser av Scientology som en religion og Scientology-kirken som en religiøs organisasjon som yter religiøse tjenester til sine menighetsmedlemmer. Scientology-kirken er registrert som en religiøs organisasjon og som en juridisk enhet.
Myndighetsorganer i Nederland uttrykker sin anerkjennelse av Scientology-religionen ved sin behandling av kirken, dens medlemmer og prester. For eksempel gir Justisdepartementet Scientology-prester rett til å besøke fengsler for å gi veiledning og bistand til innsatte; Undervisningsdepartementet gir scientologer rett til å danne sine egne skoler for å undervise sine barn i samsvar med sine religiøse overbevisninger; og skatteetaten godkjenner Scientologys status som religion.
I 2007 fikk et medlem av Scientology-kirken rettslig godkjennelse på sin petisjon om å hjemmeundervise sitt barn, basert på sin egen og sin datters religiøse overbevisninger. Domstolen baserte sin beslutning på Den europeiske menneskerettsdomstolens dom i saken Church of Scientology v. Moscow (5. april 2007, søknadsnr. 18147/02). I 1991, i samsvar med prinsippene for religiøs likestilling og ikke-diskriminering, fikk en skatteinspektør instrukser fra sine overordnede om å behandle selvangivelsen fra en Scientology-prest på samme måte som prester i andre religioner.
