For å oppnå formell religionsanerkjennelse i Italia må en organisasjon gå gjennom to trinn. Det første trinnet er en prosess hvor den entiteten som representerer den religiøse trosretningen i Italia på nasjonalt nivå oppnår anerkjennelse som juridisk person fra Innenriksdepartementet. Etter at en søknad er sendt inn gjennomfører Innenriksdepartementet en undersøkelse av søkerens kvalifikasjoner, og etter aksept registreres den som en anerkjent religiøs forening. Når prosessen er fullført og Innenriksdepartementet har stadfestet foreningens religiøse status, er det mulig å gå et skritt videre og forhandle med staten om en traktat som kalles en Intesa. Dette er en spesiell avtale med staten og er den høyeste formen for religionsanerkjennelse. Scientology-kirken har aldri forsøkt å få religionsanerkjennelse gjennom denne prosessen. Isteden er dens religiøse organisasjoner i Italia registrert som religiøse nonprofit-organisasjoner.
Formålene og aktivitetene til Scientology-kirken er blitt stadfestet som religiøse av natur ved den høyeste domstolen i Italia. Den italienske kassasjonsdomstolen (Italias høyeste juridiske autoritet) avsa en skjellsettende dom i saken Bandera og andre mot Italia (nr.16835/97) i oktober 1997, der den stadfestet at Scientology er en religiøs lære (som betyr at den besitter et religiøst formål og er engasjert i religiøse aktiviteter). Domstolen analyserte kriteriene for å definere en religion, understreket myndighetenes plikt til ikke å begrense religionsfrihet og konkluderte at Scientology er en religiøs lære.
I februar og august 1998 fritok finansministeren Scientology-kirker for skatt og klassifiserte kirkene som «religiøse nonprofit-foreninger».
Scientology-kirken har også blitt anerkjent som en religion i mange andre juridiske og administrative avgjørelser i Italia. Denne utvetydige stadfestelsen av religiøs status ble bekreftet av den italienske høyesterett i en annen dom i 2001, som bygget på den omfangsrike og nå rådende rettspraksis som erklærer at Scientology er en religiøs trosretning.
«… siden Scientology-kirken har blitt stadfestet i USA som en religiøs sammenslutning, burde den ha blitt stadfestet i Italia, og dermed bli tillatt å praktisere utøvelsen av sin religion og sine aktiviteter til å verve medlemmer ...»
